中心与国内大型港口、物流与航运公司联合建立了产业研合作基地30多个（见表12）。与振华重工（集团）股份有限公司、中交第三航务工程局有限公司、上海汽车集团股份有限公司乘用车分公司等企业建立的产学研基地获批3家国家级工程实践教育中心（教高[2012]8号）。与振华重工（集团）股份有限公司共建的 “上海海事大学港口与海洋装备校外实习基地”获得上海市市属本科高校校外实习基地重点建设项目和上海高校示范性校外实习基地建设项目立项，2012年10月，成为上海市第一批上海高校创新创业教育实验基地。
表12 物流专业校外实习基地
| 序号 | 校外实习单位 | 地址 |
| 1 | 振华重工（集团）股份有限公司 | 上海长兴岛 |
| 2 | 中特国际物流有限公司 | 上海市虹口区东大名路948号白金湾广场1704室 |
| 3 | 上海伟运国际货运有限公司 | 上海市铜仁路258号九安广场金座11楼AB室 |
| 4 | 上海大微实业发展有限公司 | 上海市东大名路888弄19号4楼 |
| 5 | 上海安吉汽车零部件物流有限公司 | 上海江浦路1000号尚凯商务大厦12-17F |
| 6 | 嘉里大通物流有限公司上海分公司 | 上海市天目西路218号嘉里不夜城第一座13楼 |
| 7 | 上海中外运海港物流有限公司 | 上海市奉贤区新杨公路7788号 |
| 8 | 上海海通洋山汽车码头有限公司 | 上海洋山深水港 |
| 9 | 上海冠东国际集装箱码头有限公司 | 上海洋山深水港 |
| 10 | 上海申舟船务有限公司 | 上海市桃林路18号A座1208室 |
| 11 | 上汽集团乘用车公司 | 上海两港大道2999号 |
| 12 | 上海畅联国际物流有限公司 | 上海外高桥保税区日京路 |
| 13 | 联邦快递（中国）有限公司 | 北京市顺义区天竺空港工业区天柱路12号 |
| 14 | 外高桥物流有限公司 | 上海外高桥 |
| 15 | 上海国际港务集团股份有限公司 | 上海市虹口区东大名路358号(国际港务大厦) |
| 16 | 中远集装箱运输有限公司 | 东大名路378号远洋大厦 |
| 17 | 中国外运物流发展有限公司上海分公司 | 金海公路6671号 |
| 18 | 中国外运华东有限公司 | 上海黄浦区福建中路188号 |
| 19 | 天津港（集团）有限公司 | 天津市津港路99号 |
| 20 | 厦门港务控股集团有限公司 | 厦门市湖里区东港北路31号港务大厦20楼 |
| 21 | 深圳市盐田港集团有限公司 | 广东省深圳市盐田区盐田港海港大厦18-19层 |
| 22 | 大连港股份有限公司 | 大连市中山区港湾街1号 |
| 23 | 南通沿海开发集团有限公司（通州湾新区） | 南通市工农南路150号 |
| 24 | 远成物流股份有限公司 | 上海市普陀区真南路2339号 |
| 25 | 德邦物流股份有限公司 | 上海市青浦区徐泾镇明珠路1018号 |
| 26 | 重庆市万州港口(集团)有限责任公司 | 重庆市万州 |
| 27 | 上海跨国采购中心有限公司 | 上海市延安西路2633号美丽华商务中心A-301 |
| 28 | 泰州港务集团 | 泰州市高港区永安洲镇迎宾大道1号 |
| 29 | 上海华谊天原化工物流有限公司 | 上海市金山区漕泾镇合展路155号 |
| 30 | 上海国际港口咨询有限公司 | 上海市虹口区黄浦路99号801室 |
